مجلات ISI ساختار و اصول ویژه‌ای برای مقالاتی که قصد چاپ آن‌ها را دارد در نظر گرفته است، لذا برای اینکه شانس پذیرش و چاپ مقاله‌ای در این مجلات افزایش یابد، رعایت این اصول ضروری است.
چاپ مقالات علمی در مجلات معتبر ISI برای محققان، دانشجویان و اساتید دانشگاه‌ها اهمیت بسیاری دارد. زیرا با این کار امتیازات پژوهشی خود را بالا می‌برند و زمینه را برای پیشرفت خود در مراحل تحصیلی بالاتر و در زمینه شغلی فراهم می‌کنند. از آنجاییکه مقالات ISI از اعتبار و امتیاز پژوهشی بالایی برخوردارند لذا کشورهایی که مقالات علمی زیادی را در این مجلات به چاپ رساندند از سطح علمی بالایی نسبت به سایر کشورها برخوردار هستند.
با توجه به اینکه مجلات ISI ساختار و اصول ویژه‌ای برای مقالات در نظر گرفته است، لذا برای اینکه مقاله‌ای شانس پذیرش و چاپ در این مجلات را داشته باشد باید این اصول را رعایت کند. پس آشنایی با اصول و ساختار مقالات ISI بسیار با اهمیت است. به همین دلیل در اینجا به توضیح مختصری در این مورد می‌پردازیم.
در حالت کلی مقاله دارای بخش‌های زیر می‌باشد:
با توجه به اینکه مفهوم اصلی مقاله توسط عنوان مقاله نشان داده می‌شود، پس باید بطور خلاصه و روان نوشته شود و حاوی کلمات کلیدی تحقیق باشد. عناوینی که طولانی هستند از امتیاز کمتری برخوردار خواهند بود.
در این قسمت نام نویسنده یا نویسندگان مقاله نوشته می‌شود. ترتیب نوشتن اسامی به میزان مشارکت آن‌ها در نگارش مقاله بستگی دارد. همچنین نام مؤسسه و یا دانشگاه‌هایی که مؤلفان در آن مشغول به کار و یا تحصیل هستند نیز در سطر بعدی نوشته می‌شود. توجه باشید که ترتیب نوشتن اسامی نویسندگان خیلی مهم می باشد، زیرا نحوه تقسیم امتیاز بین نویسندگان مقاله بر حسب ترتیب و تعداد نویسندگان می باشد.
این بخش از مقاله از اهمیت خاصی برخوردار است. زیرا این بخش از مقاله می‌تواند خواننده را از موضوع کلی تحقیق آگاه سازد. چکیده باید بطور خلاصه بین ۱۰۰ تا ۱۵۰ کلمه نوشته شود.
در انتهای چکیده واژگان کلیدی تحقیق را ذکر می‌کنند. این کلمات حداکثر چهار کلمه می‌باشد.
اولین بخش اصلی از هر مقاله علمی، مقدمه آن است. مقدمه مقاله خلاصه‌ای از فصل‌های دیگر است بطوریکه خواننده با خواندن آن از اهدف تحقیق و ضرورت انجام آن آگاه می‌شود. در این قسمت به پژوهش‌هایی که قبلا در ارتباط با این موضوع انجام گرفته است پرداخته می‌شود.
در این بخش از مقاله نویسنده باید تمام مراحل اجرای تحقیق را که شامل روش‌های اجرایی، ابزارهای پژوهش، طرح پژوهش و نحوه چگونگی تحلیل دادهها می‌باشد را شرح دهد تا خواننده بتواند بطور دقیق از چگونگی انجام پژوهش آگاه شود، آن را تکرار نماید و درباره نتایج بدست آمده داوری کند.
در این قسمت دادهها و نتایج بدست آمده از تحقیق در قالب جدول، شکل و یا نمودار نمایش داده می‌شود.
نویسنده در این بخش بصورت کاملا منطقی و به دور از هر گونه تعصب باید نتیجه معقولی از تحقیق خود بگیرد و آن را با نتایج مشابه بدست آمده در پیشین مقایسه کند و همچنین پیشنهادات سازنده‌ای برای تحقیقات آینده ارائه دهند.
از مهم‌ترین بخش‌هایی که اعتبار مقاله به آن بستگی دارد، بخش منابع مقاله است. منابع لاتین یا فارسی مورد استفاده در تحقیق باید با تمام جزئیات در انتهای مقاله ذکر شوند.
